各種水質的水樣從采集到分析測定都會經過一定的時間。時差可能從幾分鐘到幾個小時不等，有時甚至會暫停幾天。由于環境條件、微生物代謝活動和化學作用的變化，會導致水樣的一些物理參數和化學成分發生變化，導致水質檢測結果不準確。為了將這些變化降低到很低的水平，需要盡可能縮短運輸時間，盡快分析測量，采取必要的防護措施； 有些項目必須在采樣點進行測量。

(1)水樣的運輸

采集的每份水樣都應記錄下來，在采樣瓶上貼上標簽，然后運送到實驗室。在運輸過程中，請注意以下幾點：

1、擰緊取樣容器口的塞子，必要時用密封膠和石蠟密封（測油類的水樣不能用石蠟密封）。

2、為避免水樣在運輸過程中因震動、碰撞而造成損失或污染，最好將樣品瓶包裝好，用泡沫塑料或紙條將其壓緊。

3、需要冷藏的樣品應配備專用保溫容器，放入制冷劑，將樣品瓶放入其中。

4、冬季應采取保溫措施，避免樣品瓶凍裂。

(2)水樣的保存

儲存水樣的容器可能會吸附待測成分或污染水樣，因此應選擇性能穩定、雜質含量低的材料制成的容器。常用的容器材料有硼硅玻璃、石英、聚乙烯和聚四氟乙烯。其中，石英和聚四氟乙烯雜質含量低，但價格昂貴。通常，由聚乙烯和硼硅玻璃制成的容器廣泛用于日常監測。對于不能及時運輸或不能盡快分析的水樣，應根據不同監測項目的要求，采取適當的保存方法。水樣的運輸時間通常以24小時為大的允許時間。